Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL11Q8NHH1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms