Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HELBQ8NG08 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELBQ8NG08 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms