Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM58Q8NG06 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM58Q8NG06 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms