Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3C3Q8NEB9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3C3Q8NEB9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms