Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF169Q8NCN4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF169Q8NCN4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF169Q8NCN4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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