Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD1Q8NBU5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms