Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms