Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AVL9Q8NBF6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AVL9Q8NBF6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms