Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NIPA2Q8N8Q9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPA2Q8N8Q9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms