Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO5AQ8N6Q1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCO5AQ8N6Q1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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