Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC9Q8N567 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC9Q8N567 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms