Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C17orf53Q8N3J3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C17orf53Q8N3J3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms