Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT222Q8N1A0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms