Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC117Q8IWD4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC117Q8IWD4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms