Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC71Q8IV32 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC71Q8IV32 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC71Q8IV32 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC71Q8IV32 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC71Q8IV32 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC71Q8IV32 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms