Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NME9Q86XW9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NME9Q86XW9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NME9Q86XW9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms