Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM50Q86XT4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM50Q86XT4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM50Q86XT4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms