Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKAP1Q86WV1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKAP1Q86WV1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms