Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF3Q86WH2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF3Q86WH2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms