Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB4Q86W47 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms