Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM3Q86VH5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRTM3Q86VH5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms