Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT3Q86UX7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms