Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC6BQ86SZ2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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