Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP1Q7Z6B7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP1Q7Z6B7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms