Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MICAL3Q7RTP6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICAL3Q7RTP6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms