Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM47EQ6ZV65 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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