Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPGS1Q6ZTW0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms