Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM43BQ6ZT52 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM43BQ6ZT52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms