Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CXCL17Q6UXB2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL17Q6UXB2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms