Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC171Q6TFL3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC171Q6TFL3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC171Q6TFL3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms