Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L2Q6R6M4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L2Q6R6M4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L2Q6R6M4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms