Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOA5Q6Q788 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA5Q6Q788 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms