Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE2Q6PIF2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE2Q6PIF2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms