Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTR9Q6PD62 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTR9Q6PD62 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms