Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF549Q6P9A3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF549Q6P9A3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF549Q6P9A3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms