Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGMBQ6NW40 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGMBQ6NW40 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms