Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD4Q6NW29 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD4Q6NW29 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms