Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC70Q6NSX1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms