Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-8■■□□□ 14.5
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NIPBLQ6KC79 HIST1H2BC-201ENST00000314332 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.226e-10■■□□□ 14.2
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NIPBLQ6KC79 GAS5-212ENST00000434796 575 ntTSL 2-0.29□□□□□ -2.461e-42■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.899e-12■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.989e-12■■□□□ 14.2
NIPBLQ6KC79 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.019e-12■■□□□ 14.2
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