Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDE2Q6IQ49 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDE2Q6IQ49 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms