Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPPQ6IPU0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPPQ6IPU0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms