Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TYW3Q6IPR3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms