Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUMO4Q6EEV6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUMO4Q6EEV6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms