Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms