Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK5

TSHZ3, Teashirt homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ3Q63HK5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSHZ3Q63HK5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSHZ3Q63HK5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSHZ3Q63HK5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSHZ3Q63HK5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSHZ3Q63HK5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSHZ3Q63HK5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSHZ3Q63HK5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSHZ3Q63HK5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSHZ3Q63HK5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSHZ3Q63HK5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms