Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF123Q5XPI4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF123Q5XPI4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms