Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND4CQ5VZ89 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms