Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRNL1Q5VV63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRNL1Q5VV63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms