Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD1Q5VV17 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms