Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRCH2Q5VUJ6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRCH2Q5VUJ6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms